В целом, сюжет мода Lost Alpha, это другой взгляд на сюжет S.T.A.L.K.E.R. Тень Чернобыля. Очень много знакомых моментов, правда, по мере развития событий, сюжет всё больше и больше отдаляется от ТЧ.
За основу был взят мод "Путь Человека. Шаг в неизвестность. Дежавю" (ПЧШНД). Были внесены изменения и дополнения, сделан акцент на более хардкордную составляющую в прохождении и в поисках тайников.
Долина Шорохов - новый сюжет, не пересекающийся с сюжетом оригинальной игры. История простого сталкера по имени Макс, который решил подзаработать перед уходом из Зоны.
Упавшая звезда. Честь наемника начинает новую серию модов, являющихся продолжением трилогии Сталкер Апокалипсис.
Основной целью проекта Oblivion Lost Remake является восстановление сталкера в таком виде, каким бы он был, если бы вышел в начале 2004 года.
Модификация направлена на то, чтобы добавить глубину, реализм, вызов и погружение в игровой процесс с новыми функциями.
Основа сюжетной линии мода Смерти Вопреки - Послушник заключается в раскрытии судьбы одного из главных антигероев серии, с которым игрокам еще не раз предстоит столкнуться в следующих эпизодах.
Autumn Aurora 2 привносит осеннюю атмосферу в зону и значительно преображает графику, звук и геймплей S.T.A.L.K.E.R. - Shadow of Chernobyl.
История Конвона. Главный герой оказывается в совершенно непонятном для него месте. Теперь его цель – узнать о себе как можно больше.
Новый сюжет Сталкер: Фотограф позволит увидеть игроку Зону "до начала времён", когда ничего ещё не определено, когда ещё нет известных принципов и устоявшихся законов.